Врачебная наука Тибета разделяет всего человека на множество клеточек, что позволяет детально контролировать любой процесс в организме, его системах, тканях, органах. Делается это следующим образом: «Между касательными параллельными линиями, проведенными через подошву и через макушку, проводится одиннадцать главных параллельных линий, каковые делят человека на двенадцать равных частей. Каждая их этих частей в свою очередь делится тремя параллельными линиями. Таким образом, человеческое тело в поперечном направлении делится на 48 равных частей, начиная с макушки до пяток. Затем проводится продольная линия из центра лба по носу, через пупок и середину органов гениталий, а сзади — по середине спинного хребта; в обе стороны от этой линии, параллельно ей, проводится по восьми линий, расстояние между каждой из них равно 1/48 части, на которые разделено человеческое тело. Таким образом, человеческое тело в продольном направлении делится на 16 равных частей или квадратиков.
Как поперечные, так и продольные линии, проходящие спереди, например через лицевые части головы, через переднюю часть шеи и соски, через пупок и через другие части тела, сзади проходят также через определенные части головы, шеи и позвонков. Каждый индивидуум имеет свою собственную меру, поэтому и линии всегда индивидуальны. Благодаря этим линиям врач легко может определить точное положение внутренних органов, сосудов и нервов».
Анатомия «Чжуд-ши» уделяет особое внимание пяти «плотным» органам человека и «шести органам, имеющим полости». Описывая их, врачи Тибета используют образные сравнения, сопоставляя различные органы со знакомыми, узнаваемыми действиями или предметами, окружающими человека.
«Сердце обхватывается большими долями легких, которые его держат, как мать держит на руках своего ребенка. Белая часть грудобрюшной преграды (диафрагма) подобна белой занавеси. Печень подобна горе с острыми вершинами. Селезенка имеет толстые края, тонкую средину. Правая и левая почки подобны силачам со сложенными назад руками. Желудок подобен котлу для варки пищи и имеет вид редьки с четырьмя складками. Желчный пузырь подобен мешочку с золотом, привешенному к печени. Толстые кишки похожи на змею с тремя сгибами. Начало и конец тонких кишок указывают на начало и концы многочисленных оросительных канавок. Прямая кишка служит продолжением толстых кишок. Белые и темные жировые ткани брюшной полости помещаются между и впереди органов брюшной полости. Мочевой пузырь подобен мешку, отверстие которого обращено вниз. Семенной пузырь подобен железке и казнохранилищу».
То же самое и относительно костной системы и других анатомических форм: «Две кости, образующие таз и крестец, подобны ограде; сочленения позвонков подобны золотым монетам, наложенным друг на друга; аорта грудная и брюшная подобна колонне; грудная кость подобна крышке; двадцать четыре ребра подобны палочкам в юрте; хрящи подобны кайме; сосуды, нервы, фасции и сухожилия подобны наложенным доскам; мышцы и кожа подобны глиняной смазке; две кости ключицы подобны краям ограды; две лопатки подобны по крышкам углов; голова подобна второму этажу; пять отверстий подобны дверям, окнам; че репные кости подобны крышке; углубление на макушке подобно отверстию, через которое вы ходит дым; уши подобны голове орла; ноздри подобны украшениям; волосы подобны двуполым тычинкам; две руки подобны спущенным флагам; грудная и брюшная полости подобны юрте, окутанной войлоком; грудобрюшная преграда подобна цветной занавеси, отделяющей одну половину комнаты от другой; две ноги подобны столбам, воткнутым перед оградой для вязки лошадей; опасные места в организме при разного рода повреждениях подобны привилегированным лицам».
Человек, утверждает «Чжуд-ши», имеет строго определенные и очень важные отверстия и пути. Они разделяются на внутренние и наружные. Внутренних насчитывается 13. Это «дыхательные пути, пути, по которым получают питание семь тканей; пути, по которым идут три отделения; пути водообмена и первые пути пищеварения. Наружных «отверстий и каналов в области головы 7, в нижней части тела - 2; у женщин, кроме того, отверстия uteri и двух грудей. Благодаря этим путям организм получа­ет питательные материалы, при несоответствующ­ем образе жизни, пище и питье пути и отвер­стия повреждаются и возникают расстройства». Питание или слишком быстро движется, не успевая усваиваться организмом, или слишком медленно, когда пути и отверстия засоряются, отравляя окружающее пространство. «Если нет причин, расстраивающих пути и отверстия, ор­ганизм благоденствует».